钱谦益所上奏疏的大意是各派屏弃门户之间，实心用事，紧密团结在以弘光天子为核心的重建的大明朝周围。
可东山再起的阮大铖可没有这个心思，他是个狠角色，知道自己和马士英与东林的矛盾已经到了不可调和的地步。想当年，阮大铖也不是没想过和东林和解，也欲重归东林。可惜，被东林拒绝。崇祯十五年的时候，他避祸南京，结果复社名士顾杲、杨廷枢、黄宗羲等憎恶其为人，作《留都防乱公揭》对其他大肆攻击，想赶他离开南京。
可以说，双方已经结下深仇了。
阮大铖是个有仇必报的主，他不但要消灭复社，也要彻底打垮东林。
上台之后，阮大铖所干的第一件事就是暗中指使南昌建安王府镇国中尉朱统类上书揭发内阁大学士姜曰广心怀异志，图谋不轨。
朱统类乃是皇室子弟，不用问自然是马士英一伙。
他揭发姜曰广的罪行有三：一，结党；二，扬州的史可法、回乡的张慎言、在朝的姜曰广，三个地方的人相互之间信息往来不断，且相当频繁，在这一点上面，朱统类用上了夸张的手法，说这三人一日之中甚至有十多封往来信件；三，三人监场密会，好象在图谋什么。
按照正常的程序，一个镇国中尉所上的奏疏从地方上递到朝廷，先得交到通政司审核，然后再交到内阁。内阁如果觉得这折子毫无意义，一派胡言，可草拟个意见，直接退回去，根本不可能送到司礼监，也不可能送到皇帝手头
而通政司和内阁都是东林的人，按照正常图径，朱中尉上这本折子基本等于是做无用功。
所以，朱统类的奏疏到内阁之后，先是传到了主持内阁常务工作的高宏图手里，高大人看完奏折后觉得事关重大，需要先压下来，就票拟了一个意见，要求再次严查该事件，务必要保证情况的真实，之后再送上来一个肯定结果，准备发还下去。
可他万万没想到，如今内阁的拟票权却是落到马士英手里的。于是，马次辅在百忙中抽出时间检查工作，又恰好在一堆奏疏中看到朱统类的折子，也感觉事关重大，直接让人发去司礼监。
于是，这份折子就这么落到弘光皇帝手头。
弘光不看则已，一看大怒：“这么重要的事，你内阁都敢瞒我。于是马上下令把内阁的人叫了过来。”
作为一个皇帝，最看重的就是自己的权力。而皇权和相权本是天敌，双方之间的斗争几乎横亘了上下两千多年的中国历史。
对于任何一个能够打击势力膨胀的文官集团，能够让自己高度集权的机会，每一个皇帝都是不会防国的。
内阁的人刚一到，弘光就厉声斥责起：“统类和朕本是是一家人，定然不会欺瞒，高阁老你为什么还让他重新调查！”
又对高弘图一阵喝斥：“立即将史可法从扬州传回京城，朕要听他的解释。”
一通雷霆震怒之后，弘光帝马上下令成立一个专案组彻查此事，组长就是举报人朱统类。
按说这根本就不符合独立调查的规矩，问题是皇帝一意如，还说一番诸如“谁主张，谁举证”的大道理，拉偏架的态度已是赤裸裸了。
三天之后，专案组首席调查员朱统类提交正式报告，表示上次的调查没有任
何失误，绝对百分之百准确。
这下完了。消息传来，高弘图、姜曰广都吓得称病在家，连门都不敢出，生怕在被人抓住一丝把柄，送进狱里吃牢饭。在朝的大臣们也乱了阵脚，不知道到底哪儿刮来了妖风，怕把自己也带进去。
东林党人一向以铮铮铁骨不屈君子自诩，可实际上并不是这么回事。如果要说节气，靖难事的方孝儒或许有，杨廷和、杨慎父子有，可万历、天启年以来士风败坏，这样的人实在是找不出几个。满世界都是沽名钓誉之辈，满世界都是到处打秋风混吃骗喝的文人，随着资本主义萌芽，市民阶层的兴起，读书人也不可避免地俗气起来。
当年魏忠贤是办了不少东林党人，可有的时候回头看去。除了东林的区区几个党魁倒霉之外，受到阉党迫害的东林人大多是出身寒门的官员。至于家资富贵之人，却是一个没糟。如此，就让人不觉深思了----他们为什么没有受到迫害，难道就是因为魏阉喜欢有钱人----答案不言自名，有钱的东林党人走了阉党的门路，贿赂了九千岁和阉党要员。
如此看来，东林的所谓君子之名其实也就那么回事。
钱谦益的反水，搞乱了东林的思想，阮大铖的凶狠手段镇住了众君子。
人心避害趋利，大难临头，自然要各自飞。
所谓节操、骨头，大约也就脾气暴躁的张慎言和史可法还有一些。可这两人一个被逼退休，一个远在扬州，就连高弘图和姜曰广这两个领袖人物也被吓坏了。
见这二人缩卵，皇帝和马士英一党心中大定，也极度蔑视。感觉东林，已经不成其为一个对手了。
朱统类上疏一事弄到最后，矛头直指姜曰广、高弘图。
姜曰光首先沉不住气，心灰意懒，上疏乞去，帝准。同时被退休的还有东林另外一个大姥刘宗周。
前吏部尚书张慎言退休之后，后来朝廷有任命东林干将徐石麒继任。
在马士英的指示下，御史黄耳鼎、陆朗联合弹劾徐石麒，徐石麒没顶住，申请退休回家了。马士英趁此机会把自己的亲信张捷扶上了吏部尚书的宝座。
对于马士英、阮大铖一连串的沉重打击，已经被钱谦益弄得人心涣散的处于分裂状态的东林几乎没有还手之力。
马士英搞掉姜曰广、刘宗周，徐石麟之后，事情还没完。
弘光皇帝亲自出手，给了东林最后一击。他亲自出面，给了内阁仅存的东林党人高弘图一笔只相当于象征意义的退休金，四世封诰还有孙子可受荫为中书舍人特殊待遇，说高阁老年事已高，朕感谢你这几个月对我工作的支持。不过，却不忍心看你这么操劳。你老人家还是回家颐养天年吧，将高弘图送回了老家……不对，高阁老的老家在山东，现在已经落入建奴手中，他却是回不去的。
于是，高阁老只能迁居会稽。
如此，内阁已经没有一个东林党人，完全由马士英自己说了算，马瑶草也达到了权力的顶峰。
东林输得底裤都掉了。
二十年前，东林党败在了有天启撑腰，客氏帮手的魏忠贤阉党的手里，而二十年后的今天，东林党又失败了，败在他们原本极其轻视加鄙视的阉党余孽阮大铖的手中。主要原因是，马阮二人背后站着弘光皇帝。