所谓的曼哈顿工程其实就是美国陆军部研制原子弹计划，1939年初，德国化学家O.哈恩和物理化学家F.斯特拉斯曼发表了铀原子核裂变现象的论文。几个星期内,许多国家的科学家验证了这一发现,并进一步提出有可能创造这种裂变反应自持进行的条件，从而开辟了利用这一新能源为人类创造财富的广阔前景。
但是，同历史上许多科学技术新发现一样，核能的开发也被首先用于军事目的，即制造威力巨大的原子弹，其进程受到当时社会与政治条件的影响和制约。而德国早在1937年2月就开始执行了“铀计划”，目的就是为了制造出原子弹。
由于希特勒对欧洲悍然发动了侵略战争，致使欧洲以物理学家J-F.约里奥-居里为首的大批科学家被迫移居国外，这些人主要是移居到了美国。在美国，从欧洲迁来的匈牙利物理学家齐拉德.莱奥首先考虑到，一旦法西斯德国掌握原子弹技术可能带来严重后果。
经齐拉德.莱奥和另几位从欧洲移居美国的科学家奔走推动，于1939年8月由物理学家爱因斯坦写信给美国总统罗斯福，建议研制原子弹，这才引起美国政府的注意。
但由于美国政府对此并不是很感兴趣，开始只拨给6000美元的经费，直到日本袭击珍珠港后，才扩大规模，到1942年8月发展成代号为“曼哈顿工程区”的庞大计划。直接动用的人力约60万人，投资20多亿美元。
为了先于纳粹德国制造出原子弹。曼哈顿工程集中了当时除纳粹德国外西方国家最优秀的核科学家，动员了10万多人参加这一工程。
按照原来历史的发展，曼哈顿工程历时3年，耗资20亿美元，终于于1945年7月16日成功地进行了世界上第一次核爆炸，并按计划制造出两颗实用的原子弹，整个工程取得圆满成功。
但是由于陈锋的出现，大量的历史发生了根本性改变。尤其是二战的提前爆发和太平洋战争的提前爆发，促使美国的曼哈顿计划大为提前，并且提前11个月进入了爆炸试验阶段，只要试验成功就可以制造实用性原子弹了。
1944年7月30日凌晨，在新墨西哥州阿拉莫戈多的一片沙漠地带，随着一朵巨大的蘑菇云升起，世界上第一颗原子弹试验成功。
原本按照科学家们的意思。在沙漠地带实验成功之后，还要在太平洋的环礁进行一次海上试爆实验，但是却被罗斯福总统拒绝了，他命令曼哈顿工程的总指挥部立即组装实用性原子弹。
1944年8月5日，罗斯福致电陈锋和斯大林等人，邀请他们前往美国华盛顿召开对日作战会议。陈锋等人欣然前往。
在华盛顿，陈锋等人得到了美国政府的热情款待，8月6日上午，会议一开始，罗斯福就将一叠资料分发到了陈锋等人手中。
看到文件上那幅巨大的蘑菇云图片。陈锋心里“咯噔”一声，知道美国的原子弹终于制造成功了。看样子登陆作战可能要取消了。
果不其然，罗斯福在陈锋等人看完文件之后将原子弹试验成功的消息告诉了在座的几人，在与会的及国领导人当中只有中国没有开展对原子弹的研究，不管是英国还是苏联都有自己的“曼哈顿计划”，所以得知原子弹试验成功之后，斯大林等人又惊又喜又是担忧。
原子弹可不是一般的炸弹，其威力斯大林等人虽然不清楚，但是根据各国科学家们的估算，这种武器仅仅一颗就足以摧毁一座百万人的城市，端是十分可怕。现在美国率先掌握了这种武器，这对于苏联绝对是一种莫大的威胁。幸好现在双方是盟友，而这原子弹暂时也不会落到苏联人的脑袋上。
与陈锋想的一样，罗斯福提议在登陆日本本土之前，先以原子弹对日本境内的主要城市进行破坏性打击，在摧毁了日军的有生力量之后再进行登陆作战，这样盟军的损失将会小很多。
陈锋发现罗斯福其实对于原子弹的性能还不是太了解，或者说对于原子弹的威力还不是很信任，因此并不准备停止登陆，而是要双管齐下。
陈锋心里暗乐，等日本人尝到原子弹的威力之后，恐怕不用登陆就会主动投降，盟军的前期准备算是白弄了，不过这样的话他并没有说出口。
根据中美苏英四国约定，四国各出动80万军队以及500艘舰船，分别从东西南北四个方向靠近日本列岛，准备于1944年8月22日登陆日本本土作战。在此之前，8月15日，美军将会在日本首都东京以及其他两个城市各投下一颗原子弹，以打击日本政府的抵抗信心。
8月12日，陈锋由华盛顿返回重庆，当天便与政府方面进行了沟通，他告诉毛周等人，日本投降就在近期，中国政府要做好对日高级军官、政客、大商人的起诉工作，并且可以着手统计中国的战争损失了。
1944年8月15日早晨8时整，美军393d轰炸中队的B-29艾诺拉.盖伊号从天宁岛北田空军基地起飞，飞行时间约6个小时。艾诺拉.盖伊号与查尔斯.W.斯威尼少校指挥的科学观测机大艺术家号及乔治.马夸特上尉的摄影观测机一同前往日本东京。
3架B-29美机又从高空进入日本领空，为什么说又呢？是因为这段时间以来，盟军的战机不间断地对日本本土进行空袭，动则数百架战机。现在弄得日本政府对于零星进入日本领空的盟军战机几乎采取了漠视的态度。
根据美军的计划，装载有原子弹的B-29轰炸机进入日本领空之后。将根据天气情况自行确定轰炸地点，华盛顿只给出了京都、广岛、小仓、横滨这几个大致的区域。其中京都市（东京）为AA级目标，广岛市为AA级目标，横滨市为A级目标，小仓市为A级目标。
8月15日，东京天气很好，万里无云。在美军战机进入东京领空不久，日本的早期预警雷达侦测到一些美国飞机接近日本南部。许多城市发布空袭警报。包括东京和广岛以及横滨。
但是令人惊讶的是，在接近早上9:20点的时候，东京的雷达操作员决定解除空袭警报，因为从雷达上显示的信号看，进入日本的敌机数量很少，可能不会超过三架。为了节省燃料及飞机，日本已经决定不拦截小飞机编队。
不过雷达操作员却致电防空炮台。要求他们进入警备状态，一旦敌机进入东京市区，防空部队立即开炮还击。
由于解除了防空警报，所以地面上的日本民众并没有在意，因为从广播中得知这次仅仅只有三架敌军战机，而己方的防空部队已经就位。相必很快就会将敌人击落或者是赶走。因此，东京市区几乎所有的市民都在正常工作。
9点50分33秒，那架装载着原子弹的美机上的视准仪对准了日本京都守备司令部以及附近的日本军营，自动投弹装置被启动了。60秒种后，原子弹从打开的舱门落入空中。这时飞机作了一个155°的转弯。俯冲下来；一瞬间，飞行高度下降了300多米。这样做是为了尽量远离爆炸地点。
45秒种后。原子弹在离地600米空中爆炸，立即发出令人眼花目眩的强烈的白色闪光，东京中心上空随即发生震耳欲聋的大爆炸。顷刻之间，城市突然卷起巨大的蘑菇状烟云，接着便竖起几百根火柱，东京马上沦为焦热的火海。
由于侧风的缘故，原子弹偏离瞄准点守备司令部500米左右，在日本陆军大学上空600米处引爆。它的爆炸当量为16000吨TNT炸药。总破坏半径约1.6公里，11平方公里内发生火灾。约有12平方公里的市区被摧毁，东京一半左右的建筑物遭到毁灭性打击。
原子弹爆炸产生的强烈光波，使成千上万人双目失明；10亿度的高温，把一切都化为灰烬；冲击波形成的狂风，又把所有的建筑物摧毁殆尽。处在爆心极点影响下的人和物，象原子分离那样分崩离析。离中心远一点的地方，可以看到在一霎那间被烧毁的男人和女人及儿童的残骸。更远一些的地方，有些人虽侥幸还活着，但不是被严重烧伤，就是双目被烧成两个窟窿。在16公里以外的地方，人们仍然可以感到闷热的气流。由于东京人口密集，所以此次爆炸造成近10万人直接死亡，另外还有近10万人在原子弹爆炸及产生的暴风受伤。
在原子弹爆炸后不到两个小时，中美英苏四国政府再次发表声明，督促日本政府立即无条件投降，否则将会受到更加严厉的打击。
但是，东京的悲剧并未使日本立即同意接受盟国的最后通牒，也没有无条件投降。日本政府和大本营竭力掩盖东京事实真相，对外宣称是有一枚陨石陨落在东京市。
日本情报机关认为美国并没有太多的原料制造原子弹，并认为美军只有一颗原子弹，所以他们拒绝无条件投降。
1944年8月17日，美军又在日本长崎和广岛各投下一原子弹。两大城市一天内便有15万人丧生，另外还有5万人在随后的3天中死亡。
17日下午，盟国再次发表督促日本政府，立即无条件投降，否则横滨和小仓将会是成为下一个打击目标，盟军给日本政府3天的时间，3天后日本政府如无明确答复，盟军将会对日本进行核打击的同时，进行登陆作战。
1944年8月22日，日本天皇发布投降诏书，宣布无条件投降。